1945年8月，第二次世界大战战局已进入尾声。同盟国－德意志已宣布投降，美军对于日本的攻击更加激烈。随后在8月6日，日本广岛被投下第一颗原子弹。陷入窘况的日军最后的王牌，是在德意志投降后，以极机密方式接手的战斗潜舰(德潜U7/全长110公尺级)。其舰拥有极具威胁性的战斗能力，被喻为栖息在莱茵河的魔女“LORELEI”。海军军令部作战课长的仓大佐(上校)(堤真一 饰)为了阻止美军继广岛之后，继续对日本本土进行原子弹攻击，决定派出LORELEI出击作战。然而， LORELEI的舰长仓拔擢绢见少佐(役所广司 饰) 却对于军令部所提倡的特攻作战持反对意见，因而被排除在舰队任务之外，继而被调离舰队现场。